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Cómo conectar Stripe con tu programa de facturación sin incumplir Verifactu

Cobras con Stripe y cada semana alguien pasa los cobros a mano al programa de facturación. Con Verifactu a la vuelta de la esquina, no basta con descargar el PDF de Stripe. Esto es lo que hay que conectar, las opciones que existen y dónde suele fallar.

Por Juan Juárez ·

Respuesta rápida: Stripe es una pasarela de cobro, no tu programa de facturación. No se presenta como sistema adaptado a Verifactu, que será obligatorio el 1 de enero de 2027 para sociedades y el 1 de julio de 2027 para autónomos. Lo sensato es que Stripe cobre, que la factura salga de un programa de facturación que cumpla y que una integración los conecte: el cobro crea la factura, la devolución crea la rectificativa y la transferencia se concilia sola.

¿Stripe es compatible con Verifactu?

Stripe no se presenta como sistema de facturación adaptado a Verifactu: cobra, pero la factura que exige Verifactu tiene que salir de un programa de facturación que sí cumpla. Para conseguirlo tienes dos caminos, que explico más abajo: conectar Stripe con tu programa de facturación, o usar una aplicación del marketplace de Stripe que emita las facturas conforme a la normativa española.

El problema: cobras en un sitio y facturas en otro

Es muy habitual en negocios que venden cursos, suscripciones, reservas o servicios con pago online. El cliente paga con tarjeta a través de Stripe y el dinero llega. Pero la factura no se ha hecho: alguien tiene que abrir el panel de Stripe, copiar el nombre, el importe y, con suerte, el NIF, y teclearlo en el programa de facturación.

Con diez cobros al mes es una molestia. Con cien, es media jornada a la semana y una fuente constante de errores: facturas que se quedan sin hacer, devoluciones que nadie rectifica y un ingreso de Stripe en el banco que nunca coincide con la suma de las facturas.

Qué dice Stripe sobre Verifactu

Stripe tiene una herramienta para emitir facturas, y es tentador usarla como programa de facturación. Pero Stripe no se presenta como sistema informático de facturación adaptado a Verifactu. En su guía sobre Verifactu, lo que propone a los negocios españoles son aplicaciones de terceros de su marketplace, como Invopop o Billit.

Las fechas, según la nota informativa de la Agencia Tributaria sobre el Real Decreto-ley 15/2025:

  • 1 de enero de 2027 para quienes tributan por el Impuesto sobre Sociedades.
  • 1 de julio de 2027 para el resto, incluidos los autónomos.

Son las fechas vigentes al publicar este artículo; ya se aplazaron una vez, así que conviene comprobarlas. Si quieres el detalle de qué exige Verifactu al software, lo explico en cuándo es obligatorio Verifactu. Y para lo que te afecta fiscalmente a ti, tu asesoría es quien manda.

Tres formas de conectar Stripe con tu facturación

1. La integración que trae tu programa de facturación

Es lo primero que hay que mirar, porque es gratis o casi. Pero hay que leer bien qué hace cada una, porque no todas hacen lo mismo:

  • Holded. Tiene una integración oficial con Stripe para cobrar con tarjeta las facturas que emites en Holded, y sincroniza y concilia las transacciones. Lo que no hace, según sus preguntas frecuentes, es crear contactos ni facturas a partir de los cobros hechos en Stripe. Si vendes desde tu web con Stripe, esa parte hay que resolverla aparte.
  • Quipu. Su integración con Stripe anuncia la creación automática de facturas por cada cobro. Antes de fiarte, comprueba cómo trata devoluciones y comisiones.
  • Odoo. Usa Stripe como proveedor de pago dentro de Odoo: sirve si cobras desde Odoo, no para importar cobros hechos en otro sitio.

La pregunta clave es siempre la misma: ¿la integración crea la factura cuando se cobra en Stripe, o solo sirve para cobrar facturas que ya has hecho? Son dos cosas distintas, y muchas integraciones solo hacen la segunda.

2. Una aplicación que factura desde dentro de Stripe

La opción que propone Stripe: una app de su marketplace que emite la factura conforme a la normativa española a partir de los cobros. Invopop, por ejemplo, publica una guía de su integración con Stripe. Encaja si no tienes otro programa de facturación. Si ya llevas la contabilidad en Holded o en otro programa, acabarías con las facturas en dos sitios.

3. Una integración propia con los avisos de Stripe

Cuando la integración de serie no cubre tu caso, se conecta directamente. Stripe avisa de cada cosa que pasa mediante eventos (webhooks), y una automatización hecha con n8n, con Make o con código propio responde a cada uno llamando a la API de tu programa de facturación:

Pasa en Stripe Evento Pasa en tu facturación
Se completa un pagocheckout.session.completedSe crea el cliente, si no existe, y se emite la factura
Se cobra una suscripcióninvoice.paidSe emite la factura del periodo
Se devuelve un pagocharge.refundedSe emite la factura rectificativa

Eventos según la documentación de Stripe sobre suscripciones y devoluciones.

La factura se sigue emitiendo en tu programa de facturación, que es el que cumple con Verifactu. La integración solo le pasa los datos. Es el mismo principio con el que conecto un CRM con un ERP.

Los cuatro puntos donde se rompe

Conectar el cobro con la factura es la parte fácil. Lo que da problemas a los tres meses es esto:

El NIF del cliente

Sin NIF no hay factura completa para una empresa. Stripe Checkout permite pedir el identificador fiscal en el propio pago: para España admite el NIF de empresa (es_cif) y el NIF-IVA intracomunitario (eu_vat). Stripe comprueba el formato, y el NIF-IVA lo valida contra el sistema europeo VIES. Está pensado para empresas; si vendes a particulares, revisa con tu asesoría qué datos te hacen falta.

Las devoluciones

Si devuelves un pago que ya estaba facturado, el reglamento de facturación exige una factura rectificativa. Es lo que más se olvida cuando la devolución se hace con dos clics en Stripe y nadie avisa a administración. Además, según la documentación de Stripe, la comisión del cobro original no se devuelve.

Las comisiones

Stripe se queda su comisión antes de pagarte. La factura al cliente es por el importe completo, pero a tu banco llega menos. Esa diferencia es un gasto que también hay que registrar. Cómo contabilizarlo es cosa de tu asesoría; lo importante es que la integración deje el dato en algún sitio en vez de perderlo.

Las transferencias agrupadas

Stripe no te ingresa cada cobro por separado. Agrupa muchos en una sola transferencia, ya descontadas comisiones, devoluciones y disputas. Por eso el ingreso del banco nunca coincide con ninguna factura. Stripe ofrece un informe de conciliación de transferencias con el bruto, las comisiones y el neto de cada una. Funciona con las transferencias automáticas; si las haces manuales, la conciliación te toca a ti.

Cómo decidir

Tu situación Por dónde empezaría
Pocos cobros al mesHacerlo a mano con un método fijo. Automatizar no compensa todavía.
Tu programa de facturación crea facturas desde StripeUsar su integración y comprobar cómo trata devoluciones y comisiones.
No tienes programa de facturaciónValorar una app que facture desde Stripe, o elegir ya un programa pensando en Verifactu.
Tu programa solo cobra facturas, como HoldedUna integración con los eventos de Stripe que cree la factura y la rectificativa en tu programa.

Si además de Stripe tienes presupuestos y facturas que se hacen a mano, te interesa cómo automatizar la facturación y los presupuestos. Y si dudas sobre la herramienta para montarlo, tienes la comparativa entre Make, Zapier y n8n.

¿Cobras con Stripe y facturas a mano?

Dime qué programa de facturación usas y cuántos cobros tienes al mes, y te digo si basta con su integración o hace falta conectarlo.


Artículos relacionados:

Preguntas frecuentes sobre Stripe y facturación

Stripe no se presenta como sistema informático de facturación adaptado a Verifactu. Su propia guía sobre Verifactu remite a aplicaciones de terceros de su marketplace, como Invopop o Billit. Lo prudente es que la factura se emita en un programa de facturación que sí cumpla, y que Stripe se limite a cobrar.
Según la nota informativa de la Agencia Tributaria sobre el Real Decreto-ley 15/2025, el 1 de enero de 2027 para las empresas que tributan por el Impuesto sobre Sociedades y el 1 de julio de 2027 para el resto, incluidos los autónomos. Son las fechas vigentes a la publicación de este artículo.
No. Según la ayuda de Holded, su integración con Stripe permite cobrar las facturas de Holded con Stripe y sincroniza y concilia las transacciones, pero no crea contactos ni facturas de venta a partir de los pagos de Stripe. Para eso, la propia Holded remite a herramientas como Zapier.
Si la devolución modifica una venta ya facturada, la normativa de facturación exige emitir una factura rectificativa. Stripe avisa de cada devolución con el evento charge.refunded, que es el que debe disparar la rectificativa en tu programa de facturación. Además, según la documentación de Stripe, la comisión del cobro original no se devuelve.
Stripe Checkout permite activar la recogida de identificadores fiscales. Para España admite el NIF de empresa (tipo es_cif) y el NIF-IVA intracomunitario (eu_vat). Stripe comprueba el formato, y en el caso del NIF-IVA lo valida contra el sistema europeo VIES. Está pensado para empresas: para particulares conviene revisar con tu asesoría qué datos necesitas.
Porque Stripe agrupa muchos cobros en una sola transferencia y descuenta antes las comisiones, las devoluciones y las disputas. Para cuadrarlo, Stripe ofrece un informe de conciliación de transferencias con el importe bruto, las comisiones y el neto de cada una, que funciona con las transferencias automáticas.

Que cada cobro de Stripe tenga su factura, sin teclearla

Cuéntame cómo cobras y con qué facturas, y te propongo la forma más sencilla de conectarlo. También puedes escribirme desde la página de contacto.

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